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学习R语言的书籍推荐
以前人的烦恼是没有书可读,现在人的烦恼是书太多了。本着造福学习者的角度,本篇精选出十二本R书。尤其是针对我们生物信息学领域的童鞋,特别推荐2本生物信息学领域的R书。
一、初学入门:
《R in Action》 (中英文版本都可以购买到)
《The Art of_R Programming》(英文版)
入门者可首选两本,前者从统计角度入手,分高中低三部分由浅入深的讲解了如何用R来实现统计分析,需要特别注意的是《R in Action》已经有中文版了。后者从程序编写的角度入手,对R的本身特点进行了清晰的介绍。中文版应该快有了。
二、统计进阶:
《A Handbook of Statistical Analyses_Using_R》(英文版)
《Modern Applied Statistics With S》(英文版)
这两本书基本上涵盖了统计的一些高阶内容,例如多元分析、多层回归模型、荟萃分析、生存分析等内容。案例丰富,公式不多,值得反复学习参考。
三、生物信息学领域:
《R Programming for Bioinformatics》(英文版)
这本书是在理解了R的基本语法之后,主要学习上生物信息学领域的知识。
《R语言在生物医学领域的应用》(中文版)
这本书据说最近已经脱销了,等有货了大家可以看看,主要讲R语言分析生物信息学的数据,第一部分有入门的内容,初学者也可以看。
四、科学计算:
《Introduction to Scientific Programming and Simulation Using R》(英文版)
除了统计分析外,此书独特之处在于使用R来做数值分析,如求根,最优化,数值积分。还包括了一些常见的模拟技术。书后的习题和最后的案例非常有用。该书的中文版据说还在翻译。
五、数据挖掘:
《Data Mining with R_ Learning with Case Studies》(英文版)
《Machine Learning for Hackers》(英文版)
两本侧重于数据挖掘的R书,全是以案例为线索,示范的代码量很大。跟一遍下来会有很大的收获。
六、数据绘图:
《ggplot2 Elegant Graphics for Data Analysis》(英文版)
ggplot2还有什么好说的呢,R中最优秀的绘图包,但由于近期该包升级很快,这书显得有些过时。好在中文版进行了大幅更新,即将面世。
七、参考手册:
《R Cookbook》
《R in a Nutshell》
有时候我们需要类似词典的案头参考手册,以方便随时查阅。又或者可以通读一遍以查漏补缺。上面两本书虽然有些厚度,但仍然推荐之。后者的中文版也在翻译状态。